Hydra Filter är utprovade tillsammans med respektive storlek på behållare. För att uppnå bästa filtrering skall du alltid försöka använda filterpatroner avsedda för just ditt filter. Både form på filtermediet och genomströmning av vattnet i filtret är viktiga faktorer. Dock har alla metoder av filtrering en gemensam nämnare. Det är den flora av organismer som efter en tids användning bildas i filtermediet. Denna massa av organismer skall man bevara och föra över till det filtermediet man använder efter rengöring. Man kan exempelvis försiktigt rengöra filtret på en begränsad del eller lägga filtret efter rengöring i det avrunna vattnet före rengöring. Det viktigaste är att det finns en grogrund för förtsatt tillväxt av nyttiga organismer i filtret.